[检索/软件] Wikipidia上已可检索化学结构

2015-5-22 14:02
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Wikipidia上已可检索化学结构


作者:兰腾中国


Wikipedia 是一款对于检索化学物质信息来说十分有用的资源,其中已有超过15,000个平台。然而,迄今为止,只能在Wikipedia上输入文字短语检索化学式的名称(以及部分名称),商品名称,CAS登记号以及在一定程度上使用SMILES 文本。现在,一款结构检索引擎,Wikipedia 化学结构引擎,已允许在Wikipedia上进行化学结构检索。Wikipedia 化学结构引擎由诺华制药,école polytechnique fédérale de Lausanne (EPFL) Actelion 制药公司的研究员们协力出品。

网站支持通过精确的、相似的、或子结构选项来检索化学物质。网站上有四大模块:
1. 通过JSME 分子编辑器(JSMEMolecular Editor)画出结构式的模块
2. 基础信息模块可以提供在Wikipedia内查看结果以及检索相似分子的选项。
3.列表模块可以提供基于结构检索的结果列表。
4. 概要模块可以提供排行靠前的结构式的Wikipedia链接。

目前,已有将近13,263个可检索结构的条目,且条目信息通常在半夜更新。(比如,2015415日,只有13,250个可检索结构条目。)


Wikipedia化学结构检索引擎的用户界面


Wikipedia 化学结构引擎 的优点:
1.      检索结果会列出包含已画结构的所有结果,根据结果的数量来修正结果检索式。
将结构检索与关键词检索结合起来,虽然在Wikipedia中关键词会是文章标题的一部分,但是这样可以鉴别,比如:可以通过画出一个苯环以及用胺类在文本过滤中检索出所有带有苯环的胺类。
2.      检索结果仅限于常见的化学物质,比如:那些通常在Wikipedia页面可以被用来做参考的活性药物材料、农药等。

Wikipedia化学结构引擎的缺点:
1.      数据库仅限于Wikipedia上的化学物质。比如:比较热门的化学物,不是所有在Wikipedia中的化学物都可以通过结构检索来检索的,因为许多化学物只有文字信息缺少可辨认的结构信息。
2.      文章标题中的关键词可以被检索,除此之外,比如:如分子质量或者化学式这种不能用来检索的物质信息。
3.      结果以及结果链接仅限于英文版的Wikipedia,以后会在法文版或德文版的Wikipedia中实现该功能。

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