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Wikipidia上已可检索化学结构
作者:兰腾中国
Wikipedia 是一款对于检索化学物质信息来说十分有用的资源,其中已有超过15,000个平台。然而,迄今为止,只能在Wikipedia上输入文字短语检索化学式的名称(以及部分名称),商品名称,CAS登记号以及在一定程度上使用SMILES 文本。现在,一款结构检索引擎,Wikipedia 化学结构引擎,已允许在Wikipedia上进行化学结构检索。Wikipedia 化学结构引擎由诺华制药,école polytechnique fédérale de Lausanne (EPFL) 和Actelion 制药公司的研究员们协力出品。
网站支持通过精确的、相似的、或子结构选项来检索化学物质。网站上有四大模块:
1. 通过JSME 分子编辑器(JSMEMolecular Editor)画出结构式的模块
2. 基础信息模块可以提供在Wikipedia内查看结果以及检索相似分子的选项。
3.列表模块可以提供基于结构检索的结果列表。
4. 概要模块可以提供排行靠前的结构式的Wikipedia链接。
目前,已有将近13,263个可检索结构的条目,且条目信息通常在半夜更新。(比如,2015年4月15日,只有13,250个可检索结构条目。)
Wikipedia化学结构检索引擎的用户界面
Wikipedia 化学结构引擎 的优点:
1. 检索结果会列出包含已画结构的所有结果,根据结果的数量来修正结果检索式。
将结构检索与关键词检索结合起来,虽然在Wikipedia中关键词会是文章标题的一部分,但是这样可以鉴别,比如:可以通过画出一个苯环以及用“胺类”在文本过滤中检索出所有带有苯环的胺类。
2. 检索结果仅限于常见的化学物质,比如:那些通常在Wikipedia页面可以被用来做参考的活性药物材料、农药等。
Wikipedia化学结构引擎的缺点:
1. 数据库仅限于Wikipedia上的化学物质。比如:比较热门的化学物,不是所有在Wikipedia中的化学物都可以通过结构检索来检索的,因为许多化学物只有文字信息缺少可辨认的结构信息。
2. 文章标题中的关键词可以被检索,除此之外,比如:如分子质量或者化学式这种不能用来检索的物质信息。
3. 结果以及结果链接仅限于英文版的Wikipedia,以后会在法文版或德文版的Wikipedia中实现该功能。
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