对第一次实审意见有部分不同看法 怎么处理？

，请教：是先提交意见陈述书呢还是一起提交修改文件？

一起提交

按照你同意的部分修改审查意见修改申请文件，并提交修改后的替换文本和修改对照页，同时在意见陈述书中予以说明，并论证修改后的内容符合专利法的规定；然后在意见陈述书中，针对你不同意的部分审查意见进行争辩论。
当然，如果你根据你同意的部分修改审查意见修改申请文件后，比如把有不清楚的缺陷的权利要求删除了，同时也克服了你不同意的部分审查意见所指出的缺陷，例如创造性问题，那么直接论证修改后的内容符合专利法的规定，应该给予授权即可。